卡洛斯维持的表面上被不断的个人阴谋破坏了。虽然他的一些追随者支持他，因为他们相信他继承王位的权利，但其他人更关心维护巴斯克地区的地方自治。卡洛斯的军事人员和对他有重大影响的神职人员之间一直存在冲突。
在战争的头几年，有几次卡洛斯胜券在握。最后一次是1837年夏天所谓的皇家远征，卡洛斯亲自率领他的军队从纳瓦拉到马德里郊区。卡洛斯希望在不发生重大流血事件的情况下进入城市，但当看到只有一场战斗才能赢得城市的时候，卡洛斯犹豫了。几天后，卡洛斯自己决定退出；他的军队解散了，兵力只剩下原来的三分之一。
1834年，他的第一任妻子玛丽亚·弗朗西斯卡在英国去世。1837年10月，卡洛斯娶了她的姐姐、他另一个外甥女葡萄牙的玛丽亚·特蕾莎。
1838年6月，卡洛斯任命拉斐尔·马罗托为总司令。1839年2月，马罗托枪杀了四名卡洛斯派将军，并发布公告批评卡洛斯的宫廷。当卡洛斯把他赶下台后，马罗托向卡洛斯居住的托洛萨进军，把他变成了实际上的囚犯。马洛托再次被任命为总司令，他在卡洛斯宫廷上的对手被解职。随后，马罗托开始与玛丽亚·克里斯蒂娜的总司令进行私下谈判，并于1839年8月彻底抛弃了卡洛斯。
1839年9月，卡洛斯离开西班牙前往法国，在那里他被短暂监禁。在接下来的一年里，他的一些指挥官继续为他而战，特别是在加泰罗尼亚。然而，到1840年7月，几乎所有的抵抗都结束了。
1845年5月，卡洛斯放弃了西班牙王位的权利，取而代之的是他的长子卡洛斯·路易斯。后来，他用了“莫利纳伯爵”这个头衔。1855年3月10日，他在的里雅斯特（当时在奥地利帝国）去世。
1837年1月15日，在第一次卡洛斯战争期间，科尔特斯通过了一项法律，由摄政王玛丽亚·克里斯蒂娜颁布的皇家法令批准，该法律禁止卡洛斯和他的几个盟友排除西班牙王位继承继承之外，并宣布剥夺他们的西班牙头衔。他们是:卡洛斯本人，他的后裔，他的盟友和未来的妻子葡萄牙的玛丽亚·特蕾莎，玛丽亚·特蕾莎的儿子塞瓦斯蒂安，以及卡洛斯的外甥葡萄牙的米格尔一世。
此次卡洛斯战争乃是第二次，第二次卡洛斯战争，伊莎贝尔二世女王在1868年西班牙革命中被废黜后，西班牙科特于1870年11月16日推选萨伏依王室的奥斯塔公爵阿马戴乌斯为西班牙国王阿玛迪奥一世，但西班牙天主教会，许多大贵族、将军以及平民百姓却强烈反对，有人还曾试图杀害他。阿马戴乌斯被迫于1873年退位，西班牙宣布成立第一共和国。然而，阿马戴乌斯的退位，却成为卡洛斯派公开发动战争的信号。
紧接着，卡洛斯派立即暴动，支持老唐·卡洛斯之孙，第三个觊觎西班牙王位的小唐·卡洛斯三世继承王位。西班牙北部遂成了卡洛斯派的主要根据地。U .knsｈｍ 巴斯克人帮助卡洛斯派占领了大片地区。卡洛斯派还在南方的城镇建立帮杜，开展游击战。由于部分将领倒向卡洛斯派，政府军亦陷入分裂状态。到1873年末，卡洛斯派军队已经占领了埃布罗河以北，直到法国边境的整个北部地区，阿尔科伊、塞维利亚、加的斯和巴伦西亚相继落入卡洛斯派之手，卡塔赫纳城在被围困4个月后亦宣告投降。1874年初、卡洛斯派军队开始围攻毕尔巴鄂。
同年1月3日塞拉诺将军发动政变，推翻共和国，成为独裁者。2月末，他亲自前往北方指挥对卡洛斯派的战争，并解除了毕尔巴鄂之围。1874年底，政府军把伊莎贝拉之子阿方索十二世扶上王位，西班牙波旁王朝得以复辟。阿方索十二世立即采取政治和军事双管齐下的办法解决卡洛斯派的问题。他表示要大赦所有的卡洛斯分子，并确认北方各省原有的特权。1875年2月，阿方索十二世亲临前线督战，挫败了加泰罗尼亚和阿拉贡和卡洛斯派。1876年2月15日，阿方索再次发动进攻，并攻克巴斯克省潘普洛纳要塞。2月28日，小唐·卡洛斯逃往法国，战争结束。
这是原时空两卡洛斯的战争，在很久以前，1554年，也有以为疯卡洛斯，想要继承王位，再后来，西班牙内战时，佛朗哥也是靠了卡洛斯的帮助才成功的，可见，卡洛斯对西班牙影响之深，使西班牙的国力一直倒退不前，所以，为了西班牙能正常发展，只能从根本上解决这个问题，而威廉的电报上只有一个字：死！
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