凌星和风云对望一眼，都点点头，又默默地看向他们。事情出乎意料地顺利，三个多小时后，森林首先抬起头，转身面对凌星，轻声道：“尊敬的主人，已经下载完毕。”凌星脸上露出笑容，欣慰道：“很好，森林，这次你立了一大功，你以后就是我们的伙伴了。”虽然不明白凌星的意思，但她能够感觉到凌星是由衷的高兴，因此，她又低头道：“能为主人效劳，是森林的光荣。”森林一口一个主人，若在以前，凌星很快就会去纠正，但是，现在他心里思考的事情太多，没有精力再去做别的事情。拿下了机器人总司令，夺取大帝号的工作就完成了百分之八十。剩下的工作就是对大帝号进行彻底地改造，以适合人类使用。
大帝号上除雷电外，还有一百零七个机器生物。在凌星控制雷电的过程中，刘凤兰布莱克文纪牧野狄安娜守在核武库门前，共干掉了四个机器生物。这样，机器生物的数量就变成了一百零三个。当凌星向伙伴们传来已经成功获得机器人总司令的记忆时，分散在大帝号各处的伙伴们立即欢呼起来。即使受伤最重的阿里巴巴也咬着牙，手握拳头，举了举。此时流凌月正在旁边无微不至地照顾着他，看到阿里举起拳头，她也兴奋地用双手捧住阿里的拳头，眼里流下了晶莹的泪水。几乎所有的女孩子都激动地泪流满面，甜甜和狄安娜甚至失声痛哭。他们失去苗苗号后，一度对前途充满忧虑。甜甜和狄安娜则是心痛电脑苗苗，很可能她们将会天人永隔。
凌星宣布成功后，立即着手解决核武库的问题，毕竟这个问题始终像达摩克里斯之剑悬在众人的头顶上。通过雷电的记忆，凌星迅速接管了大帝号的控制权，并通过大帝号的电脑对所有无意识机器人的程序进行改进。删除了厌恶人类的程序，增加了对人类忠诚的程序。这样，大帝号中所有的无意识机器人都受到了凌星的控制。对核武库，凌星专门进行了控制。雷电把核武库作为大帝号的后备能源库来管理，而对凌星来说，核武库显然比较多余。有了新能源，有了聚能阵，有了黑晶和白晶，对他们来说，能量可以说是取之不尽，用之不竭。核武库的核辐射对机器可能影响不大，但对机器人的智能就有影响。核辐射中含有αβ射线，这些都是带电粒子，对磁场电场均有影响。这个核武库里存放着许多裂变材料，而链式反应的发生取决于中子的数量。宇宙中游离的中子辐射也很强，因此，核武库也是被隔离的。即使如此，核武库的放射性辐射剂量对人体也是致命的。凌星的第一条命令，就是制造相应的材料完全隔离核武库的辐射。第二条命令就是对舰桥，即大帝号的中心控制室进行生存改造。这些，都是急需解决的问题，他还没有跟大伙商量，就先行决定了。接下来，每个机器生物都献出了他们的源代码，接受了程序改造。直到此时，凌星他们才算真正占领大帝号。雷电因为拒绝献出源代码，所以被凌星囚禁在一个卦能空间中。
此时大帝号上共有智慧生物一百零四个，包括风云在内。但风云现在已经脱胎换骨，跟其他智慧生物有了巨大的差别。凌星等人讨论问题时，风云作为其中一员起到相当重要的作用。此时，他们十二个人就聚在舰桥讨论大帝号的改造。最后决定，以布莱克作为总工程师，所有伙伴作为副手，一百零三位机器生物作为成员。改造小组成立后，凌星跟刘凤兰打了个招呼，就匆匆忙忙地离开了。随后，布莱克集中数万名机器人开始对大帝号进行大规模地改造。一星期后，大帝号战舰外壳密封工作完成，秋冬率领一批机器人开始按照布莱克绘制的阵图在大帝号的外表面安装黑晶。而布莱克则亲自带着一些机器人在舰桥中用白晶布置聚能阵。
对于苗苗号驱动能源储存晶体的构成，布莱克利用卦能质谱仪早已解决。只是限于苗苗号上的条件，无法解析工艺，没有原材料，因而给制造储能晶体带来困难。现在，大帝号上既能对稀有矿物进行冶炼，也能使工艺变为可能。因此，这个任务就交给风云，让她带领机器生物中的工艺解析专家攻克这个难关。凌星的戒指中储存着不少的维生装置和材料，足够供应到下一批维生材料被制造出来之后。现在，凌星离开了，差不多所有的储物戒指都由秋冬保管。只有秋冬才能利用神意从戒指中取出东西。金衣战士们身上都穿着单兵飞行战衣，紫衣战士们都能用一定量的神意包裹自身，因而，他们都不会受到来自核武库和宇宙空间的辐射。布莱克按照凌星离开时的嘱托，把大帝号的速度用1g的加速度，逐渐减速，等待他的回归。伙伴们都非常默契，他们都知道凌星到底去了哪里。
在对大帝号进行改造的过程中，因为机器人和人类生活习惯的根本不同，很多改造方案需要布莱克亲自制定。因此，在技术上最擅长的布莱克，英子和甜甜经常在一起讨论布置改造计划，因为牵涉到人类生活，流凌月也当仁不让地参与进来。她提出了一项让众人吃惊的改造方案，在大帝号第一层建造绿化广场，开辟一些地方种植蔬菜和一些瓜果。同时，对第二第三层进行全面的绿化，把大帝号真正建成一个可供人类居住的星空之城。流凌月的想法也不是不切实际的，如果考虑到大帝号庞大的机器人数量，即使工程再浩大，只要给予他们足够的时间，还是能够完成。
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