自从德国军官训练的军队在中国打响名声后，各地的新军都喜欢使用德国的教官，于是更多的德国军官在本国混不下去后都喜欢到中国碰一碰运气，所以不管是从感情还是从训练水平上，徐卫也是比较中意德国军官，于是在八月份的时候从上海等地聘请了一批教授马、炮、工、辎重等科目的军官，预计在八月中旬的时候就能够到达长沙。
按清廷《陆军营制饷章》规定，国家常备军的编制以两镇为一军，两协为一镇、两标为一协，每标三营，每营四队
每镇还辖炮队一标、马队一标、一个辎重营、一个工程营，其中步、炮、工兵每队均为三排，每排三棚；马队两排，每排二棚；辎重队三排，每排三棚。
其中每镇兵员为一万两千五百一十二人，每协四千零三十八人；骑兵一标一千一百一十七人；炮兵一标一千八百三十六人；工兵一营六百六十七人；辎重一营七百六十四人；军乐队五十一人，每标二千零五人，每营六百五十九人。
常备军的编制与中国传统营制已完全不同，成为一个步、骑、炮、工、辎各兵种协同作战的单位，这是一种适合形势需要的现代化编制。
营是现阶段独立作战的最基本的单位，虽然此时还没有大炮，却拥有此时火力最猛的马克沁重机枪。
徐卫先整编了花垣砦内的护卫队，将表现优秀且愿意跟随徐卫出洋的官兵分离开，然后将那些不愿意出洋或者被淘汰的护卫队首先整编，整编后的护卫队依然是以一个营为基本单位到各地驻防，然后被替换的单位一部分距离长沙比较近的开赴长沙，距离花垣砦比较近的则开赴花垣砦接受整编。
以前护卫队每一个营总队的人数在一千一百七十人左右，而对于一个府来说，用这么多的人完全是没必要的，徐卫之所以保持这么大的编制则在于想保留更多的军队。
现在徐卫已经在名义上掌握了湖南的新军，有了官方的名义可以在长沙驻守一个镇的军队，所以下设到各府、州、直隶厅的军队就不需要这么多了，只需要一个营就完全满足需要了。
按照徐卫的计划是要整编出四个镇八个协，不过考虑到清政府的新军编制有点太小，在无线电还没有普及的情况下，一般来说编制越大越利于指挥，所以徐卫在国内的护卫队按照原先的计划编制了两个镇，而出国的军队则合编为一个师。
徐卫从一开始就以日本为假想敌，所以为了自己的军队在与日本人接触是不至于因为编制太小而吃亏，于是就将出国的军队按照四四编制政变，四个十四人的班为一个排，设置正副排长各一名，一个排满员为五十八人。
四个排为一个连，设置正副连长、生活委员各一名，配置一个十人的炊事班和两个通讯员以及四个卫生员， .kaｓh.一个连满员为二百五十一人。
四个连为一个营，设置正副营长、生活委员处长、司务长各一名，配置一个重机枪班和一个配有医生的十人医务组以及一个十人的通讯班，每个营长和生活委员处长配置一名警卫员，一个营满员为一千零四十五人。
四个营为一个团，设置正副团长、生活委员主任各一名，按照配置应该还有一个炮兵连和一个机枪连以及一个辎重连，不过大炮和机枪只能等到以后再配置，另外还有一个五十四人的团部，一个团满员为四千九百九十人。
两个团为一个旅，设置正副旅长、生活委员司长各一名，拥有一个三十人的旅部，一个旅满员为一万零一十三人。
两个旅为一个师，设置正副师长、生活委员总长各一名，按照配置拥有一个炮兵营、工兵营、辎重营，另外还有一个一百人配置的师部，一个师满员为两万三千二百六十四人。
因为在这次花垣砦保卫战的突出表现，隋勇被徐卫任命为师长，副师长徐坤和生活委员总长唐佳德则是从总队长和生活委员科长中选拔的优秀分子，尤其是生活委员总长唐佳德，他在宣讲和谈心方面有很高的造诣，是一个天生的政工人才。
以清政府的军队编制整编的军队，不论是护卫队还是湖南新军都被徐卫分批安置在湖南下辖的九府四直隶州四直隶厅，剩余的部分则驻守在长沙，并且与驻守各地的军队以一个月为期限轮流换防。
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